Frage  |
Antworten |
|
Lernen beginnen
|
|
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
ulega zmianie tautomerycznych from z ketonowej na enolowa forme co powoduje denaturacje dna
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
jest odporniejsze na denaturacje gdyz tuszuje go podatnosc na hydrolize (grupa 2'OH)
|
|
|
w kwasnym ph umiarkowanym 3-4 dna Lernen beginnen
|
|
zrywane wiazania glikozdyowe puryn - powstaje kwas apurynowy
|
|
|
mocznik i formamid powoduja Lernen beginnen
|
|
denaturacje gdyz niszcza strukture kwasu stabilizowana przez wykluczanie wody spomiedzy hydrofobowych zasad
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
sonikacja i sily tarcia = ale nie denaturuja
|
|
|
gestosc dna i sposob rozdzielenia Lernen beginnen
|
|
1,7g/cm3; rozdzial przez sedymentacje - gradient gestosci
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
dwuniciowe dna (dsDNA) najmniejsza, wieksza ma jednoniciowe (ssDNA) a najwieksza izolowane nukleotydy
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
stosunki absorbancji 260/280 - 1,8 (czysty), wieksze to RNA a mniejsze to bialko
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
utrata polowy struktury helikalnej
|
|
|
przy denaturacji absorbancja Lernen beginnen
|
|
|
|
|
topnienie jest kooperatywne Lernen beginnen
|
|
czyli bardziej labilne na topnienie rejony AT destabilizuja reszte
|
|
|
renaturacja komplementarnych nici Lernen beginnen
|
|
hybrydyzacja - gdy powoli sie ochladza a absorbancja spada
|
|
|
superhelisa o ujemnych zwojach Lernen beginnen
|
|
jesli przed powstaniem formy kolistej ulegla rozkreceniu
|
|
|
topoizomery roznia sie wylacznie Lernen beginnen
|
|
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
bromek etydyny jest interkalatorem i powoduje rozwiniecie helisy lokalne i redukcje skrecenia
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
wzrost napiecia torsyjnego, ma wieksza energie, ulatwia to inicjacje transkrypcji lub replikacje
|
|
|
ktora topoizomeraza zuzywa atp Lernen beginnen
|
|
|
|
|
polaczenie zasady z pentoza Lernen beginnen
|
|
w pozycji 1' daje nukleozyd; wiazanie glikozydowe (kow); dla puryn N9 a pirymidyn N1
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
nukleozyd + reszta fosforanowa - ester fosforanowy (pozycja 3' i 5', tylko w rybo 2')
|
|
|
w pozycji 5' ile moze byc reszt fosforanowych Lernen beginnen
|
|
3 (np. NTP i dNTP - z tego syntetyzowane sa kwasy nukleinowe)
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
polimery o duzym ladunku ujemnym - gr. fosforanowa 5' (dlatego aniony silnych kwasow)
|
|
|
ile par assad na skret w B DNA Lernen beginnen
|
|
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
mala wilgotnosc i duzo jonow na i k; 11 pz; czesciej RNA
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
lewoskretna, nukleotydy purynowe maja konformacje syn a reszta anty; 12pz (6 par dimerow)
|
|
|
najmniejsza srednica a najwiekszy skok helisy ma Lernen beginnen
|
|
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
globularna przez wiazania wodorowe wewnatrzczasteczkowe
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
NIE WIAZANIA WODOROWE; oddzialywania miedzy zasocjowanymi warstwowo parami zasad (sa hydrofobowe)
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
wypychanie wody przez hydrofobowe zasady co jest energetycznie korzystne
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
ładunek dodatni; aminokwasy zasadowe - arginina i lizyna
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
146 pz na oktamer tworzy 1,8 lewoskretnego zwoju
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
nukleosom + histon H1 - dalsze 20pz chroni przed trawieniem
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
|
|
|
najbardziej skondensowana jest chromatyna Lernen beginnen
|
|
w stadium mitozy/metafaza
|
|
|
w jakiej fazie zachodzi transkrypcja i replikacja Lernen beginnen
|
|
|
|
|
ekspresja genow u prokariota Lernen beginnen
|
|
promotor i terminator; koduje kilka bialek - policistronowy; kodujacy dna to operon; kodon start i kodon stop
|
|
|
ekspresja genow u eukariota Lernen beginnen
|
|
powstaje pre mrna przez polimeraze II; kodowane jedno bialko- monocistronowe; mrna kapowane (5') i ogon poli(A) 3' zeby stabilniejsze bylo
|
|
|
dojrzewanie mrna u eukariota Lernen beginnen
|
|
introny musza byc usuniete w jadrze przez snRNP podczas splicingu
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
odcinek dna ktory replikuje sie jako pojedyncza jednostka; prokarioty maja jeden replikon a eukariot wiele i wiele miejsc inicjacji
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
od nich zaczyna sie replikacja pozniej sa usuwane i zastepowane dna
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
calosc zapisu inf gen o sekwencji i ekspresji bialka lub rna
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
glutamina, asparaginian, co2
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
|
|
|
jak polimeraza dna III bakteryjna sprawdza Lernen beginnen
|
|
ma aktywnosc 3'-5' egzonukleazowa
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
brak grupy 3'oh - nie moze sie przylaczyc kolejny nukleotyd
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
|
|
|
enzymy naprawy dna kolejnosc Lernen beginnen
|
|
glikozydaza, endonukleaza, polimeraza, ligaza
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
dimery pirymidynowe - wiazania kowalencyjne
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
MMS (SULFONIAN) I ENU (MOCZNIK)
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
poliadenylacja konca 5' (BO 3')
|
|
|
co nie wymaga modyfikacji potranskrypcyjnej Lernen beginnen
|
|
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
sekwencja dna okreslajaca miejsce startu inicjacji transkrypcji
|
|
|
ekspresja operonu laktozowego zachodzi Lernen beginnen
|
|
przy obecnosci laktozy i braku glukozy
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
|
|
|
przy elongacji co wymaga hydrolizy GTP Lernen beginnen
|
|
odlaczenie pustego trna z miejsca p
|
|
|
bialko wiazace czapeczke cbp Lernen beginnen
|
|
|
|
|
kod jest zdegenerowany czyli Lernen beginnen
|
|
dla 20 aminokwasow jest 60 roznych trojek nukleotydow
|
|
|
niskie stezenie hemu w komorkach epo Lernen beginnen
|
|
jeden z czynnikow inicjacji translacji jest unieczynniony
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
tworzenia wiazania peptydowego
|
|
|
enzym helikaza dna u prokariota Lernen beginnen
|
|
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
starter rna zeby zaczac sytnteze nici wiodacej
|
|
|
co robi topoizomeraza typu II u prokariota Lernen beginnen
|
|
to inaczej gyraza, wprowadza ujemne superskrety co usuwa dodatnie
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
helikaza dnaB, prymaza DNA
|
|
|
co wydluza startery na obu niciach u prokariota Lernen beginnen
|
|
holoenzym polimerazy DNA III (dimer)
|
|
|
polimeraza DNA III u prokariota sklad Lernen beginnen
|
|
alfa - aktywna polimeraza, E- egzonukleaza poprawiajaca 3'-5', Beta - klamra wiazaca z dna
|
|
|
enzym co ma 3 aktywnosci i usuwa startery Lernen beginnen
|
|
polimeraza dna I - wypelnia przerwy po starterach
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
dimer holoenzymu polimerazy III, prymosom i helikazy
|
|
|
co rozlacza potomne koliste czasteczki u prokariota Lernen beginnen
|
|
|
|
|
rozpoczecie replikacji u eukariota Lernen beginnen
|
|
strefy inicjacji; replikony ulegaja inicjacji tylko raz w ciagu cyklu (nie jak prokariot)
|
|
|
niezbedne do inicjacji u eukariota jest Lernen beginnen
|
|
bialko (czynnik ograniczajacy) ktory wnika do jadra gdy otoczka jest rozpuszczona podczas mitozy
|
|
|
bialko wiazace jednoniciowy dna u eukariota Lernen beginnen
|
|
|
|
|
TRZY POLIMERAZY U EUKARIOTA Lernen beginnen
|
|
polimeraza DNA alfa (z prymaza); Polimeraza DNA delta i epsilon
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
taka sama jak sie czyta od 5' do 3'
|
|
|
jakich jonow potrzebuja enzymy restrykcyjne Lernen beginnen
|
|
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
hydrolizuje atp i powoduje terminacje
|
|
|
zeby pre mrna bylo mrna to Lernen beginnen
|
|
musi ulec kapu 5', rozciecie, poli(A) ogon na 3', splicingowi i metylacji
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
splicing; bogate w uracyl
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
bariera przed 5' egzonukleazami i stabilizacja transkryptu
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
oczyszczenie czastek mrna i utworzenie bibliotek cdna
|
|
|
|
Lernen beginnen
|
|
|
|
|
co naprawia dna jak deaminacja zasad Lernen beginnen
|
|
n-glikozydazy, b-polimeraza
|
|
|
podjednostka wieksza rybosomu - przy usuwaniu intronow Lernen beginnen
|
|
|
|
|
gdzie transferaza peptydylowa Lernen beginnen
|
|
wieksza podjednostka rybosomu - katalizuje wiazanie peptydowe
|
|
|
zeby analizowac ekspresje genu to jaka metoda pcr Lernen beginnen
|
|
cdna jako matryca czyli RT PCR
|
|
|
